Αποτελεί έλεγχο των εσωτερικών δομών του οφθαλμού όπως η ωχρά κηλίδα, το οπτικό νεύρο, τα αγγεία και η περιφέρεια του αμφιβληστροειδούς. Η βυθοσκόπηση γίνεται με τη βοήθεια ειδικών φακών κάποιοι εκ των οποίων χρησιμοποιούνται κατόπιν μυδρίασης (δηλαδή διαστολής της κόρης με κολλύριο).